เชื้อเพลิงชีวภาพเป็นส่วนสำคัญของกลยุทธ์ที่กว้างขึ้นเพื่อทดแทนน้ำมันเบนซินที่ใช้น้ำมันปิโตรเลียมดีเซลและเชื้อเพลิงเจ็ทที่เราใช้อยู่ในปัจจุบันกลยุทธ์หนึ่งที่จะทำให้เชื้อเพลิงชีวภาพมีความสามารถในการแข่งขันคือการทำให้พืชทำงานได้เอง นักวิทยาศาสตร์สามารถวิศวกรพืชเพื่อผลิตสารเคมีที่มีคุณค่าหรือผลิตภัณฑ์ชีวภาพในขณะที่พวกเขาเติบโต

จากนั้นผลิตภัณฑ์ชีวภาพสามารถสกัดได้จากโรงงานและวัสดุพืชที่เหลือสามารถเปลี่ยนเป็นเชื้อเพลิงได้ เมื่อผลิตในโรงงานเองผลิตภัณฑ์ชีวภาพสามารถช่วยลดต้นทุนของเชื้อเพลิงชีวภาพที่เกิดขึ้นได้ แต่ส่วนหนึ่งที่สำคัญของกลยุทธ์นี้ยังคงไม่แน่ชัดว่าจะต้องมีผลิตภัณฑ์ชีวภาพชนิดใดที่จะต้องทำเพื่อให้กระบวนการเป็นไปได้ทางเศรษฐกิจรวบรวมข้อมูลเกี่ยวกับกลุ่มผลิตภัณฑ์ชีวภาพที่มีการศึกษาเป็นอย่างดีว่าพืชสามารถผลิตได้อย่างมีประสิทธิภาพตั้งแต่รสชาติและน้ำหอมไปจนถึงพลาสติกย่อยสลายได้ การสร้างผลิตภัณฑ์ชีวภาพที่มีคุณค่าจะช่วยชดเชยต้นทุนการผลิตเชื้อเพลิงชีวภาพและทำให้กระบวนการทั้งหมดถูกลง